Browsing by Author "AKAR, Nejat (Tez Danışmanı)"

Now showing 1 - 1 of 1
  • No Thumbnail Available
    Item
    Epstein-barr virüs (EBV) genomunun periferik kandan PCR ve real-tıme PCR ile gösterilmesi ve tiplendirilmesi
    (Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı) TAMER, Deniz (Yazar); AKAR, Nejat (Tez Danışmanı)
    EBV, insan B lenfositlerinde latent enfeksiyona neden olan ve bu hücreleri transforme ederek in vitro sınırsız büyüme yeteneği kazanmasına neden olan bir insan herpes virüsüdür. Latent enfeksiyon süresince, viral gen ekspresyonu,(EBV nükleer antijeni) EBNA-1, EBNA-2, EBNA-3A, EBNA-3B, EBNA-3C, EBNA- LP olmak üzere 6 adet nükleer protein ve LMP (latent membran protein) olmak üzere bir integral membran proteini ile sınırlıdır. Bu proteinlerin ekspresyonu,EBV genomunun varlığını gösterir. Bu çalışmada; 44 pediatrik maligniteli olgunun periferik kan örneklerinde EBV genomu gerçek zamanlı PCR ve EBNA3C geninin 95 bç’lik delesyon bölgesi PCR yöntemiyle çalışılmıştır ve aynı zamandatiplendirmede de kullanılmıştır. Bu çalışmada, hasta grubumuzda; yaş aralığı 0-18 olan, 3’ü Hodgkin, 18’iHodgkin dışı olmak üzere 21 adet lenfomalı hasta mevcuttur. Çalışma sonucunda; gerçek zamanlı PCR ile EBV (+) olduğu bulunmuştur. Hastalarda delesyon dağılımına bakıldığında, EBNA3C Tip1’e sahip 3 (%15,7) EBNA3C Tip2’ye sahip 3 (%15,7) ve her iki EBV Tip’ine de sahip 1 (%5,3) birey bulunmuştur. EBNA 3C ile tipi belirlenemeyen örnek sayısı ise 12’dir (%63,2). RT-PCR, EBNA 3C’ye göre daha duyarlı olduğu görülmektedir. EBV (+) olması beklenen BL hasta grubunda beklenenden daha az pozitifliğin olması, diğer çalışmaların aksine bu çalışmanın periferik kan örneğinden yapılıyor olmasınabağlı olabilir. Daha spesifik sonuçlar için, daha geniş bir hasta grubuyla çalışılmalıdır.AbstractEpstein-Barr virus (EBV) is a human herpes virus that establishes latent infection in human B lymphocytes and growth-transforms these cells so that they can proliferate indefinitely in vitro. Viral gene expression during latent infection islimited to six nuclear proteins (EBV nuclear antigen) EBNA-1, EBNA-2, EBNA- 3A, EBNA-3B, EBNA-3C, EBNA-LP and one integral membrane protein, latent membrane protein (LMP) (Sample and Kieff., 1990). The expression of theseantigenes show the existence of EBV genome. In this study, Real-time PCR and 95-bp deletion in the EBNA3C gene methods were used for the detection of EBV genome in peripheral blood cells of 44 children with malignant disease and thedatas from EBNA3C deletion analyze were used to define the types of EBV. In our study of the 44 patients, there was 21 lymphoma patients, with 3 Hodgkin and 18 non-Hodgkin’s disease age range was between 0-18. 19 of the samples were EBV(+) with RT-PCR. However only 7 of them were EBV (+) by EBNA-3C PCR. Of these 3 patients with EBNA3C Type1 (15,7%), 3 patients with EBNA3C Type2 (15,7%) and 1 patients with both Type 1 and Type 2 (5,3%). EBNA3C PCR method was not able to detect EBV in 12 samples (63,2%). RT-PCR seems more spesific than EBNA3C PCR. EBV positivity difference between previous studies and this study probably lies on the fact that this study performed with peripheral blood samples, hence the others with cancer tissue.